底栖大型无脊椎动物是生活在河流和小溪底部的小型水生生物.它们可以附着在岩石、植物、树枝上，也可以挖到沉积物中. 蛤蜊、蜗牛、小龙虾和蜻蜓的幼虫只是大型无脊椎动物的几个例子 . 一般来说，大型无脊椎动物群落的多样性表明一个健康的水生生态系统. 给定一个具有一定规模和一定数量资源的生态系统, 栖息地和资源将在不同的物种群之间共享. 这是因为每个物种都适应一定范围的资源需求和栖息地条件.
不同的大型无脊椎动物物种具有不同程度的污染耐受能力. 随着生态系统的破坏, 环境条件可能发生变化，使一个或多个物种具有竞争优势. 这些物种成为优势并胜过其他物种. 在大多数情况下，耐污染的物种会茁壮成长. 在一个严重污染的生态系统中 , 能忍受污染的物种可能是唯一能存活下来的物种, 从而对系统的多样性产生负面影响.
化学测试只反映进行测试时的水质. 通过研究大型无脊椎动物群落并测量它们的多样性, 丰度和组成, 可以开发出水质的长期图景. 大型无脊椎动物研究也非常适合公民科学努力，新泽西水科学与技术中心能够为志愿者提供培训. 大型无脊椎动物研究可以成为有效的社区参与工具，并使志愿者在栖息地保护中发挥更积极的作用.